健康的皮肤有一个细菌屏障来抵御细菌:微生物群。这种复杂的微生物组合以前被认为很难破译。一组研究人员现在已经成功地利用苯并酶通过测序来识别皮肤拭子中的活细菌。他们的方法为皮肤科的诊断和治疗开辟了新的可能性。
在许多皮肤病中，如特应性皮炎和痤疮，保护皮肤的细菌层被破坏。
过去皮肤科医生研究微生物组详细组成的努力遇到了障碍。原因是:在琼脂平板上培养的传统培养基中，并不是所有的细菌都能茁壮成长，繁殖得同样好。因此，一些生长缓慢的物种可以完全被忽视。最近的遗传分析方法的缺点是，从皮肤细胞和死细菌的碎片中捕获大量的DNA序列。这降低了结果的信息价值。
K?berle博士和生物学家Yacine Amar博士都是Biedermann教授团队的成员，他们在TUM的皮肤科和过敏症诊所和综合诊所工作，他们与一个国际跨学科团队合作，开发了一种去除非目标物种DNA的方法。他们利用了苯并酶的一种特殊特性。它通过将所有生物携带遗传信息的核苷酸链分解成短片段来破坏它们。只有DNA受到外细胞壁保护的活细菌才能逃脱酶的破坏。
苯并酶已经使用了一段时间，例如用于纯化蛋白质:这种酶可以分解所有的外源DNA和RNA片段。然后用离心机将其除去，留下蛋白质。皮肤细菌的选择遵循同样的原理:来自皮肤细胞或死细菌的遗传物质被酶分解，然后可以从样品中分离出来。剩下的细菌可以被机械地消灭，这样就可以研究它们的DNA。
“我们的实验表明，通过这种方法，我们确实可以完全消除非目标DNA并选择皮肤微生物群，”项目负责人Yacine Amar说。在实验室里，他最初研究了人造样本，其中包含人类细胞和死细菌和活细菌的混合物，这些样品是通过严格的规程和苯并酶预处理产生的。这名研究人员说:“随后使用的过程——被称为16S测序——产生了完整细菌组成的高度精确的图像。”对真实皮肤拭子的分析同样成功:在样本中没有发现死细菌的残留DNA。
K?berle博士相信这种方法也将在未来的研究中发挥关键作用:“基于酶的活皮肤细菌选择可以帮助我们找到某些皮肤病的微生物生物标志物，也可以识别对疾病过程有积极影响的细菌。也许有一天它们会被用于治疗。”微生物组分析的新方法已经在TUM诊所和皮肤病综合诊所的许多皮肤病队列研究中使用。
